www.pzpf.net > Bio jAvA

Bio jAvA

BioJava是在Java平台下的一个开源工程项目,它主要被用以处理生物学数据。它包括序列处理,文件解析,CORBA协同性,DAS,ACeDB的访问,动态程序,和一些简单的统计程序。 简单的说,BioJava与Java并不是同一层次的东西,BioJava是基于Java的。

BioJava设置一个BLAST解析器解析BLAST结果代码如下: import java.io.*; import java.util.*; import org.biojava.bio.program.sax.*; import org.biojava.bio.program.ssbind.*; import org.biojava.bio.search.*; import org.biojava.bio.seq....

一般用bioperl和bioPython比较多一些

Java NIO : 同步非阻塞,服务器实现模式为一个请求一个线程,即客户端发送的连接请求都会注册到多路复用器上,多路复用器轮询到连接有I/O请求时才启动一个线程进行处理。 Java AIO(NIO.2) : 异步非阻塞,服务器实现模式为一个有效请求一个线程...

一、 Reactor and Proactor IO读写时,多路复用机制都会依赖对一个事件多路分离器,负责把源事件的IO 事件分离出来,分别到相应的read/write事件分离器。涉及到事件分离器的两种模式分别就是 Reactor和Proactor,Reactor是基于同步IO的,Proacto...

Java中的IO方式主要分为3种:BIO(同步阻塞)、NIO(同步非阻塞)和AIO(异步非阻塞)。 BIO 同步阻塞模式。在JDK1.4以前,使用Java建立网络连接时,只能采用BIO方式,在服务器端启动一个ServerSocket,然后使用accept等待客户端请求,对于每一...

用BioJava可以实现,有实例: http://biojava.org/wiki/BioJava:Tutorial:MultiAlignClustalW

AbstractMethodError 基本上都是版本不匹配造成的。你动过 tomcat 的 各个 lib 目录下的库么?比如替换过或增加了某些可能包括相同名字的类的其它库文件。 说说你的 tomcat 是怎么来的,你把哪里 jar 分别放到了 tomcat 的什么目录下。也可以考...

内存溢出啊~ 解决方法: . 手动设置MaxPermSize大小 修改TOMCAT_HOME/bin/catalina.bat(Linux下为catalina.sh),在“echo "Using CATALINA_BASE: $CATALINA_BASE"”上面加入以下行: set JAVA_OPTS=%JAVA_OPTS% -server -XX:PermSize=128M -XX:M...

I will hear everything to

网站地图

All rights reserved Powered by www.pzpf.net

copyright ©right 2010-2021。
www.pzpf.net内容来自网络,如有侵犯请联系客服。zhit325@qq.com